EM菌应用于食用菌的栽培，能改善菌料的理化性状，大大提高出菇率。食用菌的栽培可分熟料栽培和生料栽培，但以熟料栽培为主。一般产量比生料栽培高。但平菇、蘑菇、草菇等栽培中，以生料栽培的也不少。生料栽培省工、省时、省燃料。过去栽培多数加化学农药拌料，农药残存普遍超标，也容易发生霉变。如用生态EM菌液液拌料，省工、省时，不存在农药残存超标，并且出的菇白，菇厚，整齐，产量提高，还不会发生霉变。    1、用800倍稀释液拌料，含水量以手握菌料成团，松手就散为宜。然后盖上薄膜，4小时后装袋接种。    2、催菇。800倍稀释液一周喷施2次以上。每潮菇（耳）采收后清理好菌床和菌块用800倍稀释液喷洒，盖好薄膜即可。也可在调水时，在约25公斤水中加入20毫升EM原液及一勺红糖。经此法处理后菇白柄短，重量提高30％，投入产出比可达1:5。