液体食用菌菌种生产技术是综合食用菌及工业发酵技术的一门交叉学科。据资料报道，1948年，最早利用液体食用菌菌种发酵技术的是美国的Humfeld等对蘑菇进行的液体深层发酵研究[，从此食用菌的发酵生产在世界范围内兴起。1958年，美国液体深层发酵专家J.Szuecs利用发酵罐成功培养出多种食用菌菌丝体，之后液体食用菌菌种培养的报道在国内外相继出现。1960年代在日本，固体食用菌菌种称之为“第一时代菌种”一直被广泛使用。直至1999年，日本一家大型菇厂首次采用了在可动发酵罐里培养食用菌菌种的韩国模式液体菌种系统，并称之为“第二时代菌种”。在中国第四届蘑菇节，日本起源生物技术株式会社的小林恭久先生着重介绍了还原型液体食用菌菌种，称之为“第三时代菌种”，它是把人工生产的还原型固体食用菌菌种块粉碎后用无菌水稀释而成的液体食用菌菌种，还原型固体菌种具有活力强，接种量大的特点，每1200mL菌种可扩接10000瓶。目前，日本一些大型杏鲍菇食用菌菌种中心开始大规模地引进这一技术，并已经实用在杏鲍菇的生产上。在国内，1962年中国科学院植物生理研究所的陈聿美等对香菇、杏鲍菇、平菇、草菇等15种食用菌的深层培养进行研究。从此，有许多科研生产单位对多种食用菌进行了液体发酵培养的研究。但当时主要研究灵芝、蜜环菌、银耳等食用菌的液态发酵应用医药工业和食品饮料工业。直至1987年，上海师范大学的杨庆尧等首次报道以液体食用菌菌种作为原种，合成颗粒或谷粒菌种作栽培种的蘑菇制种新工艺，整个制种工序历时仅23d～27d，比旧工艺快3倍～4倍。从此，液体食用菌培养制种的成功报道在国内相继出现。目前能用液体培养制种的食用菌有双孢蘑菇、金针菇、杏鲍菇、香菇、猴头菇、黑木耳、平菇等。但由于液体食用菌菌种对生产工艺及技术条件要求高，多数试验停留在摇瓶培养阶段，并受资金和技术的限制，我国仍有相当多食用菌生产企业和个人采用传统固体菌种栽培模式。2009年，黄爱荣等利用全自动发酵罐对双孢蘑菇As2796液体食用菌菌种的发酵工艺进行了研究，并对不同扩增倍数的液体食用菌菌种的活力进行了比较。2010年，沈敏等对杏鲍菇液体食用菌菌种进行研发工作，并将液体食用菌菌种成功应用在工厂化栽培中，实现了杏鲍菇工厂化栽培的高产、优质、高效的目标。随着工业化生产和经营管理方式组织食用菌生产的进程不断推进，越来越多食用菌生产企业将液体食用菌菌种生产技术与工厂化栽培技术有机结合，来实现食用菌规模化、标准化、现代化的工厂化生产。