一.病虫害防治
　　食用菌一旦发生病虫害，往往比较难处理，而且损失已经造成。因此病虫害的综合防治更强调预防为主，防重于治的原则，并尽量采用生物防治措施，减少化学药剂的使用，以避免对食用菌产生药害和造成污染。主要预防措施有：
　　1、装料间、灭菌锅和接种间，建筑设计要合理，灭好菌的菌种袋或菌种瓶要能直接进入接种间，以减少污染的机会。接种室、培养室要经常打扫，进行消毒，要定期检查，发现有污染的菌包立即处理，不可乱丢。菌种要保证菌龄适应，没有污染；
　　2、搞好栽培室和栽培场地的卫生。裁培场地要远离仓库、饲养场、垃圾场。搞好环境卫生，减少杂菌和害虫的隐藏、孳生场所，减少人为传播的机会，并尽量减少闲杂人员进入栽培室。栽培室的门窗和通风洞口要装纱网.出人口要有一段距离保持黑暗，随手关灯，以防止害虫飞人，传播菌源。露地栽培时要清除栽培场的残株及附近的枯枝落叶、烂草及砖石瓦块。清理环境后，必要时场地还要进行杀虫，栽培室在栽培前要清扫干净，架子、墙壁、地面要彻底消毒、杀虫。要特别注意架子缝等处容易藏匿害虫的地方，对发病严重的老栽培室要进行熏蒸消毒，方法是每立方米容积用80毫升福尔马林和40克高锰酸钾混合液进行熏蒸。熏蒸时要密闭栽培室，2天后打开门窗通风换气24小时再将菌袋送人。也可用硫磺熏，用量为每立方米5克，密闭48小时，再过2天后进栽培袋；
　　3、注意原料、菌袋、工具的卫生。麸皮、玉米芯棉籽壳等易发霉变质的原料，要妥善保管好，并严防有毒物质、原料混入培养料。废料、料块、老菌袋不要堆在栽培室附近，并须经过高温堆肥处理后再用。栽培室的新旧菌袋必须分房隔开存放，绝不可混放，以免老菌袋的病虫转移到新的菌袋上。裁培工具也要分开使用，并做到严格灭菌和消毒，以预防接种感染和各种继发感染；
　　4、把好菌种质量关。对引进的菌种，要从多方面进行观察，并要试种，看其经济性状表现。在制菌种过程中，要经常取样检测，一旦发现污染，立即淘汰，确保生产菌种纯度，坚持取样检测，对于生产的菌种，要及时使用，以防老化。在栽培过程中，一旦发现有杂菌发生，应及时用药物进行注射处理，或重新灭菌；
　　5、及时清除残菇，并进行消毒。采菇后要彻底清理料面，将菇根、烂菇及被害菇蕾摘除捡出，集中深埋或烧掉，不可随意扔放；
　　6、促菇抑虫抑病。食用菌不同生长时期生长发育的条件有不同的要求，要根据其生长特性对湿度、水分、光线、酸碱度、营养、氧与二氧化碳等进行科学的管理，使整个环境适合食用菌的生长而不利于病原菌和害虫的繁殖生长，即所谓促菇抑虫抑病；
　　7、灭菌要彻底。栽培时灭菌一般采用高压或常压蒸汽灭菌方法。高压灭菌应在2个大气压下保持2.5个小时且进气和排气要十分缓慢。常压灭菌要求1小时内使锅内温度达到97-100℃。此后，对于灭菌时当容积的灭菌仓应在100度时保持8小时左右，且灭菌后，待锅内温度至50℃以下时方能出锅。
　　二.主要竞争性杂菌及防治方法
　　主要竞争性杂菌包括青霉、木霉、曲霉、链孢霉、毛霉和根霉等。在栽培过程中可以从杂菌的颜色、气味、拮抗线三个方面来识别。
　　1、从气味上来识别：而各种杂菌都具有各自的气味，多数表现为酸、臭、霉和氨味，霉菌多为大同小异的霉气味，而酵母菌多呈酸臭味。其他产氨细菌则多表现为氨水味。
　　2、从培养料表面的拮抗线来识别：食用菌菌丝和杂菌在生长过程中，两种菌丝的交界处，常出现一条洁白的白线，如同地图上的分界线，这条线就叫做拮抗线。通过这条线和接种部位、颜色、气味等条件即可识别哪一方是食用菌菌丝，哪一方是杂菌，发生的杂菌是属于哪种类型。
　　3、从颜色上来识别：不同的微生物颜色是不同的，特别是常见的霉菌，有不同颜色的分生孢子，这是简易区分的方法。
　　常见的青霉为青绿色，是发生最多的丝状菌，25℃以上均能生长，初期菌丝呈白色，逐渐成熟而出现绿色孢子，主要是接种时操作不严密或棉塞过湿所致，在高湿不通气环境中培养最易发生防治方法：选料要新鲜、培养料灭菌要彻底、培养室干燥、通风良好、生长期控制适宜的环境条件，加强通风，避免高温高湿、要及时清除污染的料，用0.2%多菌灵.高效绿霉净或克霉灵、3-5%石灰水喷施被感染部位，也可以在患处撒石灰粉覆盖、要把污染的料运往远离菇房处深层埋掉；
　　木霉为绿色，初期呈白色斑块，以后逐渐产生绿色孢子，菌块中央是深绿色，向外逐渐变浅，边缘呈白色，多发生于偏酸的环境中，25℃以上生长迅速，防治方法同青霉。曲霉与青霉相似，初期为白色，随成熟而呈黑、黄、绿色，28℃左右生长迅速，防治方法：在夏季潮湿季节，要防止棉花塞受潮，化纤棉花可好些，在高温季节，严格执行无菌操作，环境杀菌。栽培场所要干燥、通风。处理好污染料。
　　根霉开始呈灰白色蜘蛛状菌丝，以后产生黑色孢子囊，繁殖力很强，在培养基上全面繁殖，多发生于空气湿度大，料内含水量大，通风不良时，防治方法：严格无菌操作，培养室环境要通风，降低空气湿度。
　　毛霉菌丝白色较长，有的长达3～10厘米，菌落稀疏，易与杏鲍菇军四年相区别，菌丝生长较陕，多在高温、高湿、通气不良的条件下生长。防治方法：栽培原料要新鮮、干燥。灭菌要彻底。接种环境要认真消毒。培养室要干燥、清洁卫生，培养期间经常通风换气，避免高温高湿。链孢霉的菌丝疏松，较长，白色，分生孢子梗双叉分枝；分生孢子单细孢，球形成链，红色或粉红色，常发生在淀粉基质上如玉米、玉米芯上。
　　链孢霉经常发生在制种时的菌瓶内棉塞上，或培养料上，尤其在30℃以上高温高湿条件下发生最快，防治同前面几种。酵母菌为单细胞真核微生物，菌落表面润湿、粘滑，多呈乳白色，少数为红色。多发生于培养料水分大、高温情况下，引起培养料发酵变质，散发出酒酸气味。其他常见的细菌都是不具菌丝结构，一般在培养料面呈浓状物。防治方法：保证菌种纯正、无污染，控制培养料含水量，出现症状时喷洒2%石灰水戓链孢霉净，并保持菇房通风干燥。
　　三.主要害虫及防治方法
　　主要害虫有：
　　1、菇蝇：幼虫又称菌蛆，主要取食用菌子实体造成隧道而影响品质，且造成的伤口还很易被病菌感染而腐烂。防治菇蝇在不同时期应采用不同方法。出菇前有菌蛆大量发生，可用敌敌畏按0．90千克／100平方米的量进行熏蒸，同时在每个培养块上再喷0．15千克的1％氯化钾或氯化钠溶液。此外还应加强通风，调节棚内温湿度来恶化害虫生存环境，达到防治其为害的目的；
　　2、菇蚊：以幼虫期为害最大，除在培养料表面蛀食外，有的还结网罩住菇蕾，使菇体不能正常生长。防治方法：采收后喷500--800倍的敌百虫，挂杀虫灯.粘虫黄版.同时在菇棚门和窗口处还要加上尼龙纱以防成虫飞入产卵、繁殖为害；
　　3、菌虱：是一种螨类，个体很小，爬行较快，主要取食子实体和菌丝造成危害。防治时首先应杜绝虫源侵入菇棚，因其主要来源于仓库、饲料间的各种饲料里，所以利用仓库，为养菌室时要彻底消毒，并用石灰刷墙，使用前再用敌敌畏熏蒸1次；培养期间发现菌虱可用棉球沾50％敌敌畏悬挂熏蒸或喷施1％硫酸尼古丁溶液；
　　4、线虫：是一种无色的小蠕虫，体形极小，仅1毫米左右。幼虫侵害菌丝体和子实体，开始时菌盖变黑，以后整个子实体全变黑腐烂并有霉臭味。防治方法：蒸料时要使蒸汽充分接触培养料，以杀死全部线虫。出菇后，可用50毫克／千克的硫化锌喷施培养块来防治其为害；
　　5、跳虫：又名烟灰虫。它具有灵活的尾部，弹跳自如，体具蜡质，不怕水。常分布在菇床表面或潮湿的阴暗处咬食子实体。出菇前发生可用1：1000倍的敌敌畏加少量蜜糖诱杀。出菇后一般不能直接使用农药，此时可利用新鲜桔皮0．25--0．50千克切成碎片，用纱布包好榨取汁液，再加入0．50千克温水之后用1：20的比例喷施2--3次，防跳虫有效率达90％以上；
　　6、蛞蝓：俗称鼻涕虫，系软体动物，身体裸露，无外壳。其畏光怕热，白天躲在砖、石块下面及土缝中，黄昏后陆续出来取食为害，天亮前又躲起来。防治方法：米糠或豆饼加入2％砷酸钙或砷酸铝制成毒饵诱杀，也可用15--20倍氯化钠溶液地面喷洒驱除成虫。
　　7、蓟马：成虫黑色，体小，身体略扁，复眼突出，若虫桔红色。其主要吸取平菇菌体汁液，严重时可导致平菇菌体萎缩。防治方法：用40％乐果乳剂1500--2000倍液喷，或90％敌百虫、50％马拉硫磷1000--1500倍液喷雾，防效可达80％--90％。H、蝼蛄：用毒饵诱杀效果最好。其配方为敌百虫50克，米糠或麦麸1500克炒香，糖50克，白醋250毫克充分混合后撒于地面上，蝼蛄、蚊类食后立即死亡。I、其它害虫：伪步行虫、蛀板虫、等可用鱼藤精500--800倍液喷雾或80％敌敌畏1000--1500倍液喷雾都可取得较好防效。
　　四.主要生理性病害及其防治办法
　　常见的生理性病害主要有：
　　1、花菜型畸形菇：食用菌子实体不断生长，菌柄丛生分叉，不形成菌盖，在菌柄端膨大处又形成小菇蕾，类似花菜状。其病因是菇房通风条件差，通风不良，二氧化碳浓度太高，空气相对湿度接近或达到饱和。防治办法是加强通风换气，保持菇房相对湿度95%以下；
　　2、脑状畸形菇：平菇原基形成后，有的长出粗柄或不长柄呈脑状，不分化成菌盖，其病因是二氧化碳浓度高和光线太弱。防治办法是改善通风条件，增加光照。子实体原基形成后，每天通风两次以上，每次30分钟，适当增加光照，调整遮阳网或黑色地膜的密度，使光照强度达到基本上能看清报纸上字迹的程度，但子实体正常后，在接近七分成熟时，要降低光照强度，否则子实体因有趋光性会弯曲，降低商品价值；
　　3、矮脚畸形菇：菌柄短粗，菌盖小，有裂纹，色浅。病因是温度低，湿度小。防治办法是提高温度在16-18度，控制空气相对湿度在85-90%；
　　4、细柄大盖菇：其病因：菇房光线太强引起的。防治方法是调控好菇房光照强度在原基形成期，光照可强些，达200勒克斯以上，但当原基已分化出菌柄，菌盖后，应适当降低光照强度至50-100勒克斯，相当于基本上能看清报纸上字迹的程度；
　　5、幼菇萎缩干枯：幼菇及菇丛生长瘦弱，子实体呈黄褐色，菇体从顶向下萎缩枯死，分化形成的小菌盖及菌柄呈皱缩干瘪状。这是由于生理缺水和空气相对湿度低所致。防治方法是调节好培养料的含水量，出菇期保持菇房相对湿度在85-93%，出菇前后培养料含水量过低时，应及时喷水、浸袋；
　　6、水肿菇：子实体水肿状，半透明，以停止生长或死亡。病因是子实体受雨淋或喷水过重，至菇体发育受阻或死亡。防治方法是适当加强通风，禁止直接往菇体上喷水，防治雨淋；
　　7、瘤状菇：食用菌子实体形成后，长久处于菇体发育所需温度的下限，造成菌盖表面出现瘤状或颗粒状突起物。严重时菌盖干缩，菇质硬化，停止生长。防治办法是，加强冬天的保温措施，将出菇最低温度控制在10度以上。